Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf18Q7TS55 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms