Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prrc2bQ7TPM1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prrc2bQ7TPM1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms