Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Mycbp2Q7TPH6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms