Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Raver2Q7TPD6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Raver2Q7TPD6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms