Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Zfp397Q7TNK4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Zfp397Q7TNK4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms