Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN99

Cpeb3, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb3Q7TN99 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cpeb3Q7TN99 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpeb3Q7TN99 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms