Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Shq1Q7TMX5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shq1Q7TMX5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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