Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eci3Q78JN3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eci3Q78JN3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms