Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mindy1Q76LS9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms