Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SynmQ70IV5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynmQ70IV5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms