Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps27lQ6ZWY3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps27lQ6ZWY3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms