Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RfflQ6ZQM0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RfflQ6ZQM0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms