Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd3Q6ZQK0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms