Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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NinlQ6ZQ12 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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NinlQ6ZQ12 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NinlQ6ZQ12 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NinlQ6ZQ12 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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