Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd4Q6ZPR5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms