Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms