Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd300aQ6SJQ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms