Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja6Q6S5G4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms