Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptx4Q6RUU0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptx4Q6RUU0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms