Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GcsamQ6RFH4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GcsamQ6RFH4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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