Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nudcd1Q6PIP5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms