Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc57Q6PHN1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms