Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc85bQ6PDY0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc85bQ6PDY0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms