Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trak1Q6PD31 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trak1Q6PD31 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms