Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herc4Q6PAV2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms