Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsen2Q6P7W5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsen2Q6P7W5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms