Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snrnp200Q6P4T2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snrnp200Q6P4T2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms