Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnpo3Q6P2B1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms