Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slx4Q6P1D7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slx4Q6P1D7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms