Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Soga3Q6NZL0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Soga3Q6NZL0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Soga3Q6NZL0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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