Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd2Q6NXI6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd2Q6NXI6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms