Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SphkapQ6NSW3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms