Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg16l2Q6KAU8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms