Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep78Q6IRU7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms