Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KdsrQ6GV12 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms