Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scaf8Q6DID3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scaf8Q6DID3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms