Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp7Q6A4J8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp7Q6A4J8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp7Q6A4J8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp7Q6A4J8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp7Q6A4J8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms