Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rftn1Q6A0D4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms