Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thsd7aQ69ZU6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thsd7aQ69ZU6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms