Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PnkdQ69ZP3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms