Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms