Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Atg9aQ68FE2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg9aQ68FE2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9aQ68FE2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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