Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CilpQ66K08 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CilpQ66K08 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms