Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VclQ64727 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VclQ64727 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VclQ64727 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VclQ64727 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VclQ64727 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms