Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprcapQ64697 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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PtprcapQ64697 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprcapQ64697 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcapQ64697 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcapQ64697 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprcapQ64697 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprcapQ64697 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprcapQ64697 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprcapQ64697 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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PtprcapQ64697 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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