Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sdc3Q64519 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms