Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcg1Q64343 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Abcg1Q64343 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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