Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms