Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf1Q64213 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms