Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc18Q640L5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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Ccdc18Q640L5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc18Q640L5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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